Бібліотека Кокоро, захована на віддаленій гірській вершині, не приваблює багато відвідувачів. Тим не менш, вона є домом для сестер Ііни, Аруто і Кокоро, які вважають своєю місією підтримувати роботу бібліотеки замість своїх батьків. Кокоро давно мріє стати бібліотекарем в бібліотеці з такою ж назвою, як у неї, і з усіх сил намагається не відставати від старших сестер.
Через відсутність покровителів дівчатка в основному проводять час за чаюванням, бесідами і читанням. Однак, по мірі того, як кількість таємничих відвідувачів зростає, Кокоро починає дізнаватися про дивну історію бібліотеки Кокоро - місця, де, здається, розквітають маленькі дива.