Чотирнадцятирічний Сусуму бере участь в секретному високотехнологічному проекті під кодовою назвою «Білий Пегас». Основною метою цього проекту є розробка системи зменшення, яка дозволила б лікарям проникати в тіла хворих людей і лікувати їх без операцій. Однак головна мета проекту змінюється, коли зменшена до мікронного розміру група вчених, яка проникла в тіло пацієнта, стикається з інопланетними прибульцями.
Мініатюрні чужинці роблять якісь досліди над людськими тілами. З першої зустрічі обидві сторони знаходяться в постійній гонці за володіння технологічною перевагою: земляни - щоб вигнати прибульців, а гості з космосу - щоб знайти якийсь таємничий Джерело Життя людини.